TEMPUS genetiniai vėžio tyrimai – išsamus naviko genominis profiliavimas ir personalizuoto gydymo galimybės

Aprašymas

TEMPUS genetiniai vėžio tyrimai – išsamus naviko genominis profiliavimas ir personalizuoto gydymo galimybės

TEMPUS – pažangūs genetiniai ir genominiai tyrimai onkologijoje, padedantys gydytojams geriau suprasti naviko molekulines savybes ir priimti individualizuotus gydymo sprendimus. Naudojant naujos kartos sekoskaitos (angl. Next Generation Sequencing, NGS) technologiją, analizuojami vėžinių ląstelių DNR ir RNR pokyčiai, kurie gali būti svarbūs parenkant tikslinę terapiją, vertinant imunoterapijos galimybes ar ieškant tinkamų klinikinių tyrimų.

Net ir ta pačia vėžio rūšimi sergančių pacientų navikai gali turėti skirtingų genetinių pokyčių. Todėl vien vėžio lokalizacijos ir histologinio tipo ne visada pakanka norint įvertinti visas galimas gydymo kryptis. Išsamus naviko genominis profiliavimas leidžia išsamiau įvertinti molekulinius pokyčius, kurie gali turėti įtakos ligos eigai ir atsakui į gydymą.

TEMPUS tyrimų pasirinkimai apima:

• • TEMPUS xT – 648 genų naviko DNR tyrimas.
  • TEMPUS xR – viso transkriptomo RNR tyrimas.
  • TEMPUS xE – viso egzomo DNR tyrimas.
  • TEMPUS xF – 105 genų skystosios biopsijos tyrimas iš kraujo.
  • TEMPUS xF+ – išplėstinis 523 genų skystosios biopsijos tyrimas iš kraujo.
  • Hematologinių piktybinių ligų molekuliniai tyrimai – TEMPUS xT ir xR tyrimai gali būti taikomi ir kraujo bei kaulų čiulpų piktybiniams navikams tirti.

Konkretus tyrimas arba jų derinys parenkamas pagal onkologinės ligos tipą, klinikinę situaciją ir gydytojo nustatytą poreikį.

 

TEMPUS AI oficialus platintojas Lietuvoje – UAB „Placenta“. Dėl tyrimų galimybių, užsakymo ir mėginių logistikos galite kreiptis į PLACENTA.LT.

 

Kas yra TEMPUS genetinis vėžio tyrimas?

TEMPUS genetinis vėžio tyrimas – tai molekulinės diagnostikos tyrimas, kurio metu analizuojami naviko genetiniai pokyčiai ir, priklausomai nuo tyrimo, genų raiška. Priklausomai nuo pasirinkto tyrimo, gali būti tiriama naviko DNR, RNR arba kraujyje cirkuliuojanti naviko DNR.

Tyrimo tikslas – nustatyti kliniškai reikšmingus molekulinius pokyčius, kurie gali suteikti papildomos informacijos apie vėžio biologiją ir padėti gydytojui įvertinti galimus gydymo pasirinkimus.

Genominiai tyrimai yra svarbi precizinės onkologijos, dar vadinamos personalizuota onkologija, dalis. Gydymas parenkamas atsižvelgiant ne tik į diagnozę, bet ir į konkretaus naviko molekulines savybes.

Pavyzdžiui, dviem pacientams gali būti diagnozuotas plaučių vėžys, tačiau vieno paciento navike gali būti nustatytas EGFR geno pakitimas, o kito – ALK geno susiliejimas. Tokie radiniai gali būti svarbūs svarstant skirtingas tikslinio gydymo galimybes.

Svarbu: TEMPUS tyrimas nėra vėžio gydymo metodas. Tai diagnostinis tyrimas, suteikiantis gydytojui papildomos informacijos apie naviką. Tyrimo rezultatai ne visais atvejais lemia gydymo pakeitimą.

 

Kodėl svarbu ištirti naviko genetinius pokyčius?

Vėžys vystosi dėl ląstelėse atsirandančių genetinių ir kitų molekulinių pokyčių. Kai kurie jų skatina nekontroliuojamą ląstelių dauginimąsi, padeda navikui išvengti organizmo apsauginių mechanizmų arba gali turėti įtakos atsparumui gydymui.

Tradiciniai diagnostikos metodai leidžia nustatyti naviko vietą, dydį, išplitimą ir audinio tipą. Genominis profiliavimas šią informaciją papildo duomenimis apie naviko molekulines savybes.

Ką gali atskleisti naviko genominis tyrimas?

• Genetinius pokyčius, kuriems gali būti taikomas tikslinis gydymas. Nustačius tam tikrą pokytį, gydytojas gali įvertinti atitinkamos terapijos galimybes.
• Molekulinius žymenis, svarbius imunoterapijai. Pavyzdžiui, MSI arba TMB, kai jų vertinimas kliniškai pagrįstas.
• Galimus atsparumo gydymui mechanizmus. Kai kurie genetiniai pokyčiai siejami su mažesniu jautrumu vaistams.
• Galimybes dalyvauti klinikiniuose tyrimuose. Dalis tyrimų skirti konkrečius molekulinius pokyčius turintiems navikams.
• Papildomą informaciją apie naviko biologiją. Tai gali būti aktualu sudėtingais klinikiniais atvejais.

Ne kiekvienas genetinis pokytis turi aiškią klinikinę reikšmę. Vaisto tinkamumas priklauso ne vien nuo mutacijos, bet ir nuo vėžio tipo, stadijos, ankstesnio gydymo bei kitų aplinkybių.

 

Kokie TEMPUS genetiniai tyrimai atliekami?

TEMPUS siūlo skirtingos apimties molekulinius tyrimus. Vieni atliekami iš naviko audinio, kiti – iš kraujo. Kai kuriais atvejais gydytojas gali rekomenduoti kelių tyrimų derinį.

TEMPUS xT – 648 genų naviko DNR tyrimas

TEMPUS xT – išsamus naviko DNR tyrimas, kurio metu analizuojami 648 su vėžiu susiję genai. Jis skirtas naviko molekuliniam profiliui įvertinti ir galimai kliniškai reikšmingiems pokyčiams nustatyti.

Tyrimas paprastai atliekamas iš naviko audinio. Kai pasirenkamas naviko ir normalaus mėginio palyginimas, papildomai naudojamas kraujo arba seilių mėginys.

• Vieno nukleotido pokyčiai ir nedidelės insercijos bei delecijos.
• Genų kopijų skaičiaus pokyčiai ir tam tikri genų persitvarkymai.
• Mikrosatelitų nestabilumas (MSI) ir naviko mutacinė našta (TMB).

Šie duomenys gali padėti gydytojui nustatyti gydymui reikšmingus molekulinius žymenis ir įvertinti tikslinės terapijos, imunoterapijos ar klinikinių tyrimų galimybes.

 

TEMPUS xR – viso transkriptomo RNR tyrimas

TEMPUS xR – viso transkriptomo RNR sekoskaitos tyrimas, leidžiantis analizuoti naviko RNR. DNR tyrimas parodo genetinės informacijos pakitimus, o RNR analizė suteikia papildomos informacijos apie genų raišką ir transkriptus.

Kai kurie genų susiliejimai (fuzijos), pavyzdžiui, ALK, ROS1, RET arba NTRK genų, gali būti svarbūs tam tikrų navikų gydymo pasirinkimams. TEMPUS xR gali papildyti xT tyrimo rezultatus.

• Genų susiliejimai ir tam tikri RNR splaisingo pokyčiai.
• Genų raiška – informacija apie tai, kurie genai naviko ląstelėse yra aktyvūs.
• Kiti RNR lygmens pokyčiai pagal tyrimo analitinę apimtį.

RNR analizė ypač naudinga, kai vien DNR tyrimo nepakanka tam tikriems genų susiliejimams ar kitiems kliniškai reikšmingiems pokyčiams įvertinti.

 

TEMPUS xE – viso egzomo sekoskaitos tyrimas

TEMPUS xE – viso egzomo DNR sekoskaitos tyrimas, apimantis daugiau kaip 19 000 genų. Egzomas – baltymus koduojančių genomo sričių visuma.

Tyrimas gali būti svarstomas sudėtingais klinikiniais atvejais, kai reikia labai plataus genetinių pokyčių įvertinimo. Jis atliekamas iš naviko audinio, o palyginimui naudojamas kraujo arba seilių mėginys.

 

TEMPUS xF – skystoji biopsija iš kraujo

TEMPUS xF – 105 genų skystosios biopsijos (angl. liquid biopsy) tyrimas iš kraujo. Analizuojama kraujyje cirkuliuojanti laisvoji DNR, įskaitant naviko kilmės fragmentus, jei jų pakanka.

Neigiamas skystosios biopsijos rezultatas ne visada reiškia, kad navikas neturi tiriamų pakitimų. Kai kurie navikai į kraują išskiria mažai DNR.

TEMPUS xF gali būti svarstomas:

• Kai naviko audinio nepakanka molekuliniam tyrimui.
• Kai naujos biopsijos atlikimas sudėtingas.
• Kai gydytojui reikalinga papildoma molekulinė informacija.

 

TEMPUS xF+ – išplėstinė 523 genų skystoji biopsija

TEMPUS xF+ – išplėstinis skystosios biopsijos tyrimas, kurio metu analizuojami 523 genai. Jis gali būti pasirenkamas, kai reikia platesnės kraujyje cirkuliuojančios naviko DNR analizės.

Palyginti su xF, šis tyrimas apima daugiau genų, tačiau platesnė analizė ne visais atvejais suteikia papildomos kliniškai reikšmingos informacijos. Platesnė panelė nepašalina skystajai biopsijai būdingų apribojimų. Rezultato informatyvumas priklauso nuo naviko biologijos ir kraujyje esančio naviko DNR kiekio.

TEMPUS tyrimų palyginimas

Tyrimas	Analizės apimtis	Mėginys	Paskirtis
xT	648 genai	Naviko audinys	Naviko DNR profiliavimas
xR	Visas transkriptomas	Naviko audinys	RNR ir genų susiliejimų analizė
xE	>19 000 genų	Naviko audinys ir normalus mėginys	Viso egzomo analizė
xF	105 genai	Kraujas	Skystoji biopsija
xF+	523 genai	Kraujas	Išplėstinė skystoji biopsija

 

Kokius genetinius pakitimus gali nustatyti TEMPUS tyrimai?

DNR mutacijos

Mutacijos – DNR sekos pokyčiai. Onkologijoje gali būti vertinami EGFR, KRAS, BRAF, PIK3CA ir kiti genai. To paties geno skirtingų variantų klinikinė reikšmė gali skirtis.

Genų susiliejimai (fuzijos) ir persitvarkymai

Genų susiliejimai susidaro susijungus skirtingų genų dalims. Kai kurių navikų atvejais reikšmingi ALK, ROS1, RET arba NTRK genų susiliejimai.

Genų amplifikacijos

Amplifikacija – geno kopijų skaičiaus padidėjimas. Pavyzdžiui, ERBB2 geno amplifikacija gali būti svarbi kai kurių navikų gydymui. HER2 būklei įvertinti gali būti atliekami imunohistocheminiai (IHC) arba fluorescencinės in situ hibridizacijos (FISH) tyrimai.

Mikrosatelitų nestabilumas (MSI)

MSI yra molekulinis požymis, susijęs su DNR klaidų taisymo sistemos sutrikimais. MSI-H (didelis mikrosatelitų nestabilumas) tam tikrais atvejais svarbus vertinant imunoterapijos galimybes.

Naviko mutacinė našta (TMB)

TMB apibūdina somatinių mutacijų kiekį naviko DNR tam tikrame DNR sekos ilgyje (paprastai viename megabazės vienete). Jo reikšmė priklauso nuo naviko tipo ir klinikinės situacijos. Vien TMB rezultato nepakanka nuspręsti dėl imunoterapijos.

 

Kokių vėžio rūšių atvejais gali būti naudingi TEMPUS tyrimai?

Naviko genominis profiliavimas gali būti svarstomas sergant įvairiomis onkologinėmis ligomis, tačiau jo nauda nėra vienoda visiems navikams ir ligos stadijoms.

Plaučių vėžys

Nesmulkiųjų ląstelių plaučių vėžio atveju gali būti svarbūs EGFR, ALK, ROS1, KRAS, BRAF, MET, RET, NTRK ir kiti molekuliniai žymenys. Jie gali padėti įvertinti tikslinio gydymo galimybes.

Krūties vėžys

Gydymui svarbūs hormonų receptoriai ir HER2 būklė. Tam tikrais atvejais papildomai gali būti vertinami PIK3CA, ESR1 ir kiti genetiniai pokyčiai.

Storosios ir tiesiosios žarnos vėžys

Išplitusios ligos atveju gali būti reikšmingi KRAS, NRAS, BRAF ir kiti genetiniai pokyčiai, taip pat MSI arba DNR klaidų taisymo sistemos būklė.

Kiaušidžių vėžys

Gali būti svarbūs BRCA1, BRCA2 ir kiti DNR taisymo genai, taip pat homologinės rekombinacijos nepakankamumo (HRD) vertinimas.

Prostatos vėžys

Tam tikrų pažengusio prostatos vėžio formų atveju gali būti vertinami BRCA1, BRCA2, ATM ir kiti su DNR taisymu susiję genai.

Kasos vėžys

Molekulinė analizė gali padėti nustatyti retesnius, bet potencialiai reikšmingus genetinius pokyčius, įskaitant BRCA1, BRCA2, KRAS ir kitus.

Melanoma

Kai kuriais atvejais ypač svarbus BRAF mutacijų nustatymas. Platesnis profiliavimas gali suteikti papildomos informacijos.

Kiti solidiniai navikai

Genominiai tyrimai taip pat gali būti svarstomi sergant skrandžio, stemplės, tulžies takų, šlapimo pūslės, inkstų, galvos ir kaklo bei kitų organų vėžiu.

Ar TEMPUS tyrimas reikalingas konkrečiu atveju, sprendžia gydantis gydytojas.

 

Kada rekomenduojama svarstyti TEMPUS tyrimą?

1. Kai nustatytas išplitęs arba metastazavęs vėžys.

Molekuliniai duomenys gali būti svarbūs įvertinant galimas gydymo kryptis.

2. Kai standartinis gydymas neveiksmingas

Jeigu liga progresuoja, papildomas profiliavimas gali padėti ieškoti kitų gydymo pasirinkimų, tačiau jų negarantuoja.

3. Kai svarstomas tikslinis gydymas

Prieš skiriant kai kuriuos vaistus būtina nustatyti konkrečius molekulinius žymenis.

4. Kai svarstoma imunoterapija

Priklausomai nuo vėžio rūšies gali būti vertinami MSI, TMB, PD-L1 ir kiti molekuliniai žymenys; ne visi nustatomi DNR sekoskaita. Jiems nustatyti gali būti reikalingi skirtingi tyrimo metodai.

5. Kai ieškoma klinikinių tyrimų

Molekuliniai radiniai gali padėti įvertinti atitiktį tam tikriems klinikinių tyrimų kriterijams.

6. Kai navikas retas arba jo biologija neaiški

Platesnė analizė gali suteikti papildomos informacijos, bet nepakeičia histologinio tyrimo.

 

TEMPUS tyrimas iš audinio ar kraujo – kuo skiriasi?

Naviko audinio tyrimas

Naviko audinys gaunamas biopsijos arba operacijos metu. Kartais galima naudoti anksčiau paimtą ir patologijos laboratorijoje saugomą mėginį, jeigu jis atitinka kokybės reikalavimus. Iš naviko audinio atliekami TEMPUS xT, xR ir xE tyrimai.

Skystoji biopsija

Skystoji biopsija atliekama iš kraujo. Kraujo mėginyje tiriami cirkuliuojantys naviko DNR fragmentai. Šis metodas gali būti naudingas, kai audinio nepakanka, tačiau ne visada gali pakeisti audinio tyrimą. Skystosios biopsijos tyrimai – TEMPUS xF ir xF+

Ar galima atlikti abu tyrimus?

Kai kuriais atvejais gydytojas gali nuspręsti derinti audinio ir kraujo tyrimus. Jų rezultatai gali papildyti vienas kitą ir suteikti išsamesnės informacijos apie naviko molekulines savybes.

 

Kuo TEMPUS tyrimas skiriasi nuo paveldimo vėžio rizikos tyrimo?

Naviko genominis tyrimas ir paveldimo polinkio į vėžį tyrimas nėra tas pats. Naviko tyrimas pirmiausia skirtas vėžinių ląstelių genetiniams pokyčiams nustatyti. Tokie pokyčiai dažnai yra įgyti gyvenimo metu ir nebūtinai paveldimi.

Paveldimos rizikos tyrimas skirtas genetiniams variantams, kurie gali būti perduodami palikuonims. Pavyzdžiui, BRCA1 ar BRCA2 geno pokytis navike savaime neįrodo, kad jis paveldėtas.

Kai kuriuose TEMPUS tyrimuose naviko DNR lyginama su kraujo arba seilių mėginio DNR. Vis dėlto naviko genominis tyrimas nepakeičia specializuoto paveldimo vėžio rizikos tyrimo. Įtariant paveldimą polinkį rekomenduojama gydytojo genetiko konsultacija.

 

Kaip atliekamas TEMPUS genetinis tyrimas Lietuvoje?

1. Gydytojas įvertina tyrimo poreikį

Įvertinama diagnozė, ligos stadija, ankstesni tyrimai ir gydymas. Parenkamas tinkamas tyrimas.

2. Užpildoma užsakymo forma

Nurodomi paciento, gydytojo ir diagnozės duomenys, pasirinkti tyrimai bei mėginių informacija.

3. Pasirašomas informuotas sutikimas

Pacientui paaiškinamas tyrimo tikslas, galima nauda, apribojimai ir duomenų tvarkymas.

4. Paruošiamas mėginys

Priklausomai nuo pasirinkto tyrimo, naudojamas naviko audinys arba kraujas skystajai biopsijai. Kai reikalingas naviko ir nenavikinės DNR palyginimas, papildomai gali būti paimamas kraujo arba seilių mėginys.

5. Mėginys išsiunčiamas į laboratoriją

Mėginys siunčiamas į TEMPUS laboratoriją JAV; atliekama kokybės patikra ir molekulinė analizė.

6. Parengiama ataskaita

Pateikiami nustatyti molekuliniai pokyčiai ir jų klinikinės reikšmės vertinimas pagal pasirinkto tyrimo apimtį. Ataskaita pateikiama tyrimą užsakiusiam gydytojui.

7. Gydytojas aptaria rezultatus

Gydantis gydytojas įvertina radinius kartu su kitais klinikiniais duomenimis ir aptaria galimus tolesnius sprendimus.

 

Kokie mėginiai reikalingi TEMPUS tyrimams?

Naviko audinys

Dažniausiai naudojamas FFPE audinys – formalinu fiksuotas ir parafine įlietas naviko mėginys. Pageidautina pateikti tinkamą audinį iš naujausios biopsijos ar operacijos.

• Paprastai reikia bent 20 % navikinių ląstelių.
• TEMPUS xE tyrimui reikia bent 40 % navikinių ląstelių.
• Optimalus naviko audinio plotas – 25 mm², minimalus – 5 mm².
• Mėginys gali būti pateikiamas parafino blokeliu arba tinkamai paruoštais pjūviais.

Nurodyti reikalavimai gali skirtis priklausomai nuo pasirinkto tyrimo ir mėginio tipo. Galutinį mėginio tinkamumą įvertina laboratorija.

Kraujas ir seilės

Kraujas ir seilės gali būti naudojami kaip nenavikiniai (normalūs) palyginamieji mėginiai, padedantys atskirti naviko genetinius pokyčius nuo paveldimų genetinių variantų.

Kraujas taip pat naudojamas TEMPUS xF ir xF+ skystosios biopsijos tyrimams.

Mėginių paėmimo, paruošimo ir transportavimo sąlygos priklauso nuo pasirinkto tyrimo.

Ką parodo TEMPUS tyrimo rezultatai?

TEMPUS tyrimo ataskaitoje pateikiama informacija apie naviko molekulines savybes ir jų galimą klinikinę reikšmę. Ataskaitos turinys priklauso nuo pasirinkto tyrimo ir nustatytų genetinių pakitimų.

Joje gali būti pateikiama:

• Naviko genetiniai pakitimai – nustatytos mutacijos, genų susiliejimai, kopijų skaičiaus pokyčiai ir kiti tiriami molekuliniai pakitimai.
• Kliniškai reikšmingi molekuliniai žymenys – pavyzdžiui, mikrosatelitų nestabilumas (MSI) ar naviko mutacinė našta (TMB), jei šie rodikliai vertinami pasirinktu tyrimu.
• Galimos gydymo kryptys – informacija apie vaistus, kurių veiksmingumas ar atsparumas jiems gali būti susijęs su nustatytais naviko pakitimais.
• Moksliniais įrodymais pagrįsta informacija – nustatytų pakitimų klinikinė reikšmė, remiantis aktualiomis onkologijos gairėmis ir moksliniais duomenimis.
• Klinikiniai tyrimai – informacija apie galimus klinikinius tyrimus, susijusius su nustatytais molekuliniais pakitimais, jei tokia informacija pateikiama ataskaitoje.

Vertinant galimas gydymo alternatyvas, TEMPUS ataskaitose remiamasi NCCN onkologijos klinikinėmis gairėmis, specializuota onkologinių žinių baze „OncoKB“, moksliniais duomenimis apie vaistų veiksmingumą ir JAV Maisto ir vaistų administracijos (FDA) patvirtintomis vaistų indikacijomis. Šie šaltiniai padeda įvertinti nustatytų genetinių pakitimų klinikinę reikšmę ir galimas gydymo pasirinkimo galimybes.

Svarbu: TEMPUS ataskaitoje nurodyti vaistai nebūtinai yra registruoti Europos Sąjungoje, kompensuojami ar prieinami Lietuvoje. TEMPUS tyrimo rezultatai padeda priimti gydymo sprendimus, tačiau galutinį gydymo planą nustato gydytojas onkologas, atsižvelgdamas į paciento diagnozę, ligos eigą, bendrą sveikatos būklę ir galiojančias gydymo rekomendacijas.

 

TEMPUS AI ir dirbtinis intelektas – kaip analizuojami duomenys?

TEMPUS AI yra JAV technologijų ir molekulinės diagnostikos įmonė, kurianti sprendimus precizinei medicinai. Jos veikloje derinami genominiai tyrimai, bioinformatinė analizė ir dirbtinio intelekto technologijos, padedančios apdoroti bei interpretuoti didelius medicininių duomenų kiekius.

Atliekant TEMPUS genominius tyrimus, sekoskaitos duomenys analizuojami bioinformatiniais metodais, siekiant nustatyti genetinius pakitimus ir įvertinti jų galimą klinikinę reikšmę.

Svarbu: dirbtinis intelektas ir bioinformatinė analizė yra pagalbinės technologijos. Tyrimo rezultatai vertinami atsižvelgiant į mokslinius įrodymus ir individualią paciento klinikinę situaciją. Galutinį sprendimą dėl gydymo priima gydytojas onkologas.

 

Kuo TEMPUS tyrimai skiriasi nuo kitų genetinių tyrimų?

Genetiniai navikų tyrimai skiriasi analizuojamų genų skaičiumi, nustatomų pakitimų tipais ir klinikine paskirtimi. Tinkamiausias tyrimas parenkamas atsižvelgiant į vėžio rūšį, ligos eigą ir gydytojui aktualius klausimus.

Vieno geno tyrimas

Skirtas konkretaus geno pakitimams nustatyti. Gali būti pakankamas, kai žinoma, kokį genetinį pakitimą reikia ištirti.

Nedidelė genų panelė

Vienu metu analizuojami keli ar keliasdešimt pasirinktų genų. Toks tyrimas gali būti tinkamas, kai konkrečiai vėžio rūšiai svarbiausi genetiniai biožymenys yra žinomi.

Išsamus naviko genominis profiliavimas

Vienu tyrimu analizuojama daug genų ir įvairių tipų genetinių pakitimų. Priklausomai nuo pasirinkto TEMPUS tyrimo, gali būti vertinamos genų mutacijos, susiliejimai, kopijų skaičiaus pokyčiai ir papildomi molekuliniai rodikliai, pavyzdžiui, mikrosatelitų nestabilumas (MSI) ar naviko mutacinė našta (TMB).

Viso egzomo tyrimas

Analizuojamos baltymus koduojančios genomo sritys – egzomas. TEMPUS xE tyrimas apima daugiau kaip 19 000 genų ir suteikia galimybę plačiau įvertinti naviko genetinius pakitimus.

Svarbu: didesnis analizuojamų genų skaičius savaime nereiškia, kad tyrimas bus naudingesnis kiekvienam pacientui. Svarbiausia, ar pasirinktas tyrimas gali suteikti kliniškai reikšmingos informacijos, padedančios gydytojui priimti sprendimus dėl gydymo.

 

Papildomi TEMPUS molekuliniai ir imunohistocheminiai tyrimai

Be išsamaus naviko genominio profiliavimo, TEMPUS siūlo papildomus tyrimus, kurie gali padėti įvertinti naviko savybes, tikslinio gydymo ar imunoterapijos galimybes ir ligos prognozę. Tyrimų poreikis priklauso nuo vėžio rūšies ir individualios klinikinės situacijos.

PD-L1 imunohistocheminis tyrimas

PD-L1 (angl. Programmed Death-Ligand 1) – baltymas, dalyvaujantis imuninės sistemos atsako reguliavime. Imunohistocheminiu tyrimu (IHC) vertinama jo raiška naviko audinyje. PD-L1 raiška gali būti svarbi vertinant imunoterapijos galimybes sergant tam tikrais plaučių, galvos ir kaklo, skrandžio bei kitais piktybiniais navikais.

HER2 tyrimas

HER2 (angl. Human Epidermal Growth Factor Receptor 2) – ląstelių augimo signalus perduodantis baltymas, kurį koduoja ERBB2 genas. Imunohistocheminiu tyrimu (IHC) vertinama HER2 baltymo raiška, o prireikus papildomais metodais gali būti nustatoma ERBB2 geno amplifikacija. HER2 būklė ypač svarbi sergant krūties ir skrandžio vėžiu, nes gali padėti įvertinti tikslinio gydymo galimybes.

DNR klaidų taisymo sistemos (MMR) baltymų tyrimas

MMR (angl. Mismatch Repair) – DNR klaidų taisymo sistema, padedanti ištaisyti DNR kopijavimo metu atsiradusias klaidas. Imunohistocheminiu tyrimu vertinama keturių pagrindinių MMR baltymų – MLH1, MSH2, MSH6 ir PMS2 – raiška. Šių baltymų raiškos praradimas gali rodyti DNR klaidų taisymo sistemos sutrikimą (dMMR), kuris gali būti reikšmingas vertinant imunoterapijos galimybes. Kai kuriais atvejais toks rezultatas taip pat gali būti pagrindas papildomam ištyrimui dėl Lyncho sindromo.

Kiti molekuliniai žymenys

Priklausomai nuo naviko tipo ir klinikinės situacijos, gali būti atliekami papildomi tyrimai, padedantys tiksliau nustatyti naviko savybes, įvertinti prognozę ar galimas gydymo alternatyvas.

• CLDN18.2 tyrimas. CLDN18.2 (angl. Claudin 18.2) – baltymo klaudino 18 izoforma. Imunohistocheminiu tyrimu vertinama šio baltymo raiška naviko audinyje. Tyrimas aktualus sergant tam tikrais skrandžio ir gastroezofaginės jungties navikais, kai svarstomos į CLDN18.2 nukreipto gydymo galimybės.
• FOLR1 (FRα) tyrimas. FRα (angl. Folate Receptor Alpha) – folatų receptorius alfa, kurį koduoja FOLR1 genas. Imunohistocheminiu tyrimu vertinama šio baltymo raiška naviko audinyje. Tyrimas ypač aktualus sergant tam tikrais kiaušidžių vėžio tipais, kai svarstomos į FRα nukreipto gydymo galimybės.
• c-MET tyrimas. c-MET (angl. Mesenchymal–Epithelial Transition Factor) – baltymas, dalyvaujantis ląstelių augimo ir dauginimosi procesuose. Imunohistocheminiu tyrimu vertinama jo raiška naviko audinyje. Šis biožymuo tam tikrais atvejais gali būti reikšmingas vertinant tikslinio gydymo galimybes.
• 1p/19q kodelecijos tyrimas. 1p/19q kodelecija (angl. 1p/19q codeletion) – genetinis pakitimas, kai naviko ląstelėse prarandamos tam tikros 1-osios ir 19-osios chromosomų dalys. Tyrimas ypač svarbus diagnozuojant oligodendrogliomą, tikslinant naviko klasifikaciją ir vertinant ligos prognozę.
• MGMT promotoriaus metilinimo tyrimas. MGMT (angl. O6-Methylguanine-DNA Methyltransferase) – DNR pažeidimus taisantis baltymas, kurį koduoja MGMT genas. Tyrimu vertinamas MGMT geno promotoriaus metilinimas – epigenetinis pokytis, galintis sumažinti geno aktyvumą. Šis rodiklis ypač svarbus sergant glioblastoma, nes gali padėti prognozuoti atsaką į gydymą temozolomidu.

Svarbu: papildomi tyrimai nėra automatiškai įtraukti į kiekvieną TEMPUS užsakymą. Jų poreikis, prieinamumas ir mėginio tinkamumas vertinami individualiai.

 

TEMPUS tyrimų privalumai

• Išsamus naviko genetinių pakitimų vertinimas. Priklausomai nuo pasirinkto tyrimo, galima analizuoti šimtus ar tūkstančius genų ir nustatyti įvairių tipų molekulinius pakitimus.
• DNR ir RNR analizės galimybės. Skirtingi tyrimo metodai gali suteikti papildomos informacijos apie naviko genetinius pakitimus ir genų raišką.
• Skystosios biopsijos galimybė. Kraujo tyrimas gali būti naudingas, kai naviko audinio nepakanka arba audinio biopsiją atlikti sudėtinga.
• Informacija individualizuotam gydymui. Tyrimo rezultatai gali padėti gydytojui įvertinti tikslinio gydymo, imunoterapijos ir dalyvavimo klinikiniuose tyrimuose galimybes.
• Tyrimo pasirinkimas pagal klinikinį poreikį. Skirtingos TEMPUS tyrimų apimtys leidžia pasirinkti tinkamą metodą atsižvelgiant į vėžio rūšį, turimą mėginį ir gydytojui aktualius klausimus.

Pagrindinė TEMPUS tyrimų vertė – išsami informacija apie naviko molekulines savybes, galinti padėti priimti individualizuotus gydymo sprendimus.

 

TEMPUS tyrimų apribojimai – ką būtina žinoti?

• Ne visada nustatomi gydymui reikšmingi genetiniai pakitimai. Net ir atlikus išsamų genominį tyrimą, gali nebūti aptikta pakitimų, pagal kuriuos būtų galima parinkti tikslinį gydymą.
• Ne kiekvienam nustatytam pakitimui yra tinkamas gydymas. Kai kuriems genetiniams pakitimams šiuo metu nėra patvirtintų ar pacientui prieinamų gydymo būdų.
• Gydymo galimybės priklauso nuo vaistų prieinamumo. TEMPUS ataskaitoje nurodyti vaistai nebūtinai yra registruoti Europos Sąjungoje, kompensuojami ar prieinami Lietuvoje.
• Rezultatų informatyvumas priklauso nuo mėginio kokybės. Nepakankamas navikinių ląstelių kiekis ar netinkama mėginio būklė gali riboti galimybę nustatyti genetinius pakitimus.
• Skystoji biopsija turi savų apribojimų. Jei navikas į kraują išskiria mažai DNR, tyrimas gali neaptikti esamų genetinių pakitimų. Todėl neigiamas skystosios biopsijos rezultatas ne visada reiškia, kad navike jų nėra.
• Ne visų genetinių pakitimų klinikinė reikšmė yra žinoma. Kai kurie nustatyti variantai gali neturėti aiškios reikšmės gydymo pasirinkimui.
• Genominis tyrimas nepakeičia kitų diagnostikos metodų. Rezultatai vertinami kartu su histologinių, radiologinių ir kitų klinikinių tyrimų duomenimis.

Svarbu: TEMPUS tyrimas negarantuoja, kad bus nustatytas tinkamas gydymo būdas ar pasiekti geresni gydymo rezultatai.

 

Dažniausiai užduodami klausimai apie TEMPUS genetinius vėžio tyrimus

Ar TEMPUS tyrimas gali padėti parinkti vėžio gydymą?

Taip. TEMPUS tyrimai gali nustatyti naviko genetinius pakitimus, kurie padeda gydytojui įvertinti tikslinio gydymo, imunoterapijos ar dalyvavimo klinikiniuose tyrimuose galimybes. Vis dėlto ne kiekvienu atveju tyrimo rezultatai lemia gydymo plano pakeitimą.

Ar TEMPUS tyrimas parodo, kuris vaistas bus veiksmingas?

Ne. Tyrimas gali nustatyti biožymenis, susijusius su tikėtinu atsaku į tam tikrus vaistus ar atsparumu jiems, tačiau negali garantuoti gydymo veiksmingumo konkrečiam pacientui.

Kokioms onkologinėms ligoms skirti TEMPUS tyrimai?

TEMPUS tyrimai gali būti taikomi sergant įvairiais solidiniais navikais ir hematologinių piktybinių ligų genetiniam profiliavimui. Tinkamiausias tyrimas parenkamas pagal diagnozę ir klinikinį poreikį.

Ar TEMPUS tyrimui būtina nauja biopsija?

Nebūtinai. Tyrimui gali tikti anksčiau paimtas naviko audinys, jeigu jo kiekis ir kokybė atitinka laboratorijos reikalavimus.

Ar TEMPUS tyrimą galima atlikti iš kraujo?

Taip. TEMPUS xF ir xF+ yra skystosios biopsijos tyrimai, atliekami iš kraujo. Tačiau skystoji biopsija ne visada pakeičia naviko audinio tyrimą.

Kuo skiriasi TEMPUS xF ir xF+?

TEMPUS xF analizuoja 105 genus, o xF+ – 523 genus. Abu tyrimai atliekami iš kraujo, tačiau skiriasi analizuojamų genų skaičiumi ir tyrimo apimtimi.

Kuo skiriasi TEMPUS xT ir xE?

TEMPUS xT analizuoja 648 genus, o xE – daugiau kaip 19 000 genų baltymus koduojančiose genomo srityse.

Ar TEMPUS tyrimas gali nustatyti paveldimą polinkį į vėžį?

Kai kuriuose TEMPUS tyrimuose gali būti nustatomi ir paveldimi genetiniai variantai. Tačiau naviko genominis profiliavimas nėra tapatus specializuotam paveldimo polinkio į vėžį tyrimui.

Ar TEMPUS tyrimas gali padėti įvertinti imunoterapijos galimybes?

Taip. Priklausomai nuo pasirinkto tyrimo, gali būti vertinami su imunoterapijos veiksmingumu susiję biožymenys, pavyzdžiui, mikrosatelitų nestabilumas (MSI) ar naviko mutacinė našta (TMB). Jų klinikinė reikšmė priklauso nuo vėžio rūšies ir kitų veiksnių.

Ar TEMPUS tyrimas tinka ankstyvos stadijos vėžiui?

Kai kuriais atvejais taip. Tyrimo poreikis priklauso nuo naviko tipo, ligos stadijos ir planuojamo gydymo. Ne kiekvienam ankstyvos stadijos vėžiu sergančiam pacientui reikalingas išsamus genominis profiliavimas.

Kiek laiko užtrunka TEMPUS tyrimas?

TEMPUS tyrimo rezultatai paprastai pateikiami per 10 darbo dienų nuo tinkamo mėginio gavimo laboratorijoje. Tyrimo trukmė gali skirtis priklausomai nuo pasirinkto tyrimo, mėginio kokybės ir papildomų analizių poreikio. Preliminarų rezultatų pateikimo terminą rekomenduojama patikslinti prieš užsakant tyrimą.

Kokia kalba pateikiami TEMPUS tyrimo rezultatai?

TEMPUS tyrimo ataskaita pateikiama anglų kalba tiesiogiai tyrimą užsakiusiam gydytojui. Gydytojas pacientui paaiškina tyrimo rezultatus, jų klinikinę reikšmę ir galimą įtaką gydymo pasirinkimui.

Ar TEMPUS tyrimą galima užsisakyti savarankiškai?

TEMPUS onkologinius tyrimus užsako gydytojas, įvertinęs paciento diagnozę, turimus tyrimų rezultatus ir medicininį poreikį.

Kiek kainuoja TEMPUS genetinis vėžio tyrimas?

Kaina priklauso nuo pasirinkto tyrimo ir papildomų analizių.

TEMPUS genetinių vėžio tyrimų kainos prasideda nuo 1 100 €. Pavyzdžiui, TEMPUS xT kainuoja 2 500 €, xF – 2 800 €, o xE – 4 900 €. Visos tyrimų kainos pateikiamos TEMPUS kainoraštyje.

Dėl aktualių kainų ir užsakymo sąlygų kreipkitės į PLACENTA.LT.

 

TEMPUS genetiniai vėžio tyrimai Lietuvoje – kur kreiptis?

UAB „Placenta“ – oficialus TEMPUS AI platintojas Lietuvoje. Jeigu Jums arba artimajam diagnozuota onkologinė liga, pirmiausia aptarkite genominio tyrimo poreikį su gydančiu gydytoju.

PLACENTA.LT komanda gali suteikti informaciją apie tyrimus, užsakymo dokumentus, mėginių reikalavimus ir organizacinius tyrimo atlikimo klausimus.

UAB „Placenta“
Santaros g. 5, Vilnius
Tel. +370 616 00300
El. paštas: tyrimai@placenta.lt
www.placenta.lt

TEMPUS – daugiau informacijos apie naviką, kad gydymo sprendimai būtų priimami atsižvelgiant į individualias jo molekulines savybes.